Jonathan Nazet débute ses études musicales à l’École nationale de musique de Montbéliard, où il obtient un premier prix d’alto à l’unanimité. À l’âge de seize ans, il entre au Conservatoire national supérieur de musique de Paris dans la classe de Gérard Caussé et en sort quatre ans plus tard avec les premiers prix à l’unanimité d’alto et de musique de chambre (formation en quatuor avec David Grimal, Joachim Massias et Antoine Lederlin). Il poursuit ses études en « Solistklasse » à la Hochschule für Musik-Akademie de Bâle dans la classe de Hatto Beyerle tout en étant membre de l’Orchestre de la Communauté Européenne (ECYO) sous la direction de Carlo Maria Giulini et de Mstislav Rostropovitch. La musique de chambre occupe une part importante dans sa vie musicale. Il s’est ainsi produit dans de nombreux festivals en Europe avec entre autres les membres des quatuors Enesco et Via Nova, Pierre-Laurent Aimard, Philippe Bernold, Alexandre Brussilovsky, Renaud Capuçon, David Grimal, Catherine Michel, Xavier Philips, Guy Touvron, Laurent Verney. Il est actuellement membre titulaire à l’Orchestre de l’Opéra national de Paris.